消毒柜在使用过程中，用完的餐具必须先洗干净，将水擦干后才放进消毒柜内，不能承受高温的餐具必须放进低温层。一些人常把带水的餐具放入柜内又不经常通电，致使消毒柜的各电器元件及金属表面受潮氧化，在红外发热管管座处出现接触电阻，易烧坏管座或其他部件，缩短消毒柜的使用寿命。
有些人出于种种原因对消毒柜少用或闲置，而正确的使用方法是：每１－２天通电消毒一次，这样既起到杀毒的目的，又可延长其使用寿命。另外，消毒柜应放置在干燥通风处，离墙不小于３０厘米。消毒期间非必要时不要开门，以免影响效果。消毒结束后，如过十分钟再取用的话效果更佳。